MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16B

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021525	TAAA	2	8	24	31	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021525	ATTT	2	8	44	51	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021525	TAA	2	6	168	173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021525	GATG	2	8	323	330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021525	GAA	2	6	339	344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021525	AAC	2	6	467	472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021525	GAA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021525	GAT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021525	TGA	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021525	ATA	2	6	667	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021525	A	6	6	675	680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021525	TTCG	2	8	769	776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021525	T	6	6	854	859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021525	AAT	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021525	TCT	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021525	T	6	6	996	1001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021525	CCA	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021525	TAGGTT	2	12	1036	1047	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021525	GTT	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021525	CTT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021525	TAT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021525	TTC	2	6	1163	1168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021525	GTT	2	6	1174	1179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021525	TTG	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021525	CTTT	2	8	1228	1235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021525	T	6	6	1301	1306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021525	GTC	2	6	1310	1315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021525	CAT	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021525	TTG	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021525	TTG	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021525	CATCAA	2	12	1387	1398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021525	TTG	2	6	1417	1422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021525	TCA	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021525	CTT	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
35	NC_021525	CTTG	2	8	1570	1577	0 %	50 %	25 %	25 %	513844789
36	NC_021525	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	513844789
37	NC_021525	GC	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	513844789
38	NC_021525	CTGTT	2	10	1683	1692	0 %	60 %	20 %	20 %	513844789
39	NC_021525	TCTT	2	8	1768	1775	0 %	75 %	0 %	25 %	513844789
40	NC_021525	T	7	7	1833	1839	0 %	100 %	0 %	0 %	513844789
41	NC_021525	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
42	NC_021525	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	513844789
43	NC_021525	TCT	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
44	NC_021525	ACT	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844789
45	NC_021525	TTC	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
46	NC_021525	AAACA	2	10	2169	2178	80 %	0 %	0 %	20 %	513844789
47	NC_021525	A	6	6	2178	2183	100 %	0 %	0 %	0 %	513844789
48	NC_021525	CAT	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844789
49	NC_021525	T	6	6	2234	2239	0 %	100 %	0 %	0 %	513844789
50	NC_021525	A	7	7	2369	2375	100 %	0 %	0 %	0 %	513844789
51	NC_021525	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844789
52	NC_021525	CCT	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021525	AATT	2	8	2479	2486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021525	AGT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021525	CAC	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021525	A	6	6	2735	2740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021525	TTCG	2	8	2806	2813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021525	T	6	6	2893	2898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021525	ATA	2	6	3050	3055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021525	CAG	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021525	CAAAA	2	10	3137	3146	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021525	TAA	2	6	3199	3204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021525	TCT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021525	T	6	6	3217	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021525	TCA	2	6	3267	3272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021525	AAT	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021525	AGCA	2	8	3326	3333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021525	TCA	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021525	T	8	8	3356	3363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021525	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021525	TTAAA	2	10	3407	3416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021525	TAGT	2	8	3429	3436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021525	AGAA	2	8	3461	3468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021525	TTTG	2	8	3494	3501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021525	T	7	7	3525	3531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021525	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021525	AATGA	2	10	3583	3592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021525	CCA	2	6	3671	3676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021525	TAG	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021525	CAA	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021525	A	6	6	3736	3741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021525	CTTG	2	8	3788	3795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021525	TAA	2	6	3841	3846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021525	AACCA	2	10	3853	3862	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021525	TAAT	2	8	3929	3936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021525	GGAA	2	8	4012	4019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021525	AGC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021525	T	7	7	4119	4125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021525	TAG	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021525	ACG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021525	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021525	CTT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021525	TTG	2	6	4330	4335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021525	GTTAT	2	10	4372	4381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021525	T	6	6	4384	4389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021525	GAT	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021525	GTA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021525	TTG	2	6	4592	4597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021525	A	7	7	4607	4613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021525	ACA	2	6	4630	4635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021525	TTAT	2	8	4869	4876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021525	GATA	2	8	4880	4887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021525	CAA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021525	CAA	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021525	TTAT	2	8	5038	5045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021525	AT	3	6	5148	5153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021525	T	6	6	5188	5193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021525	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021525	GT	3	6	5264	5269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021525	AAT	2	6	5284	5289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021525	AGG	2	6	5295	5300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021525	ACA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021525	TATG	2	8	5383	5390	25 %	50 %	25 %	0 %	513844790
114	NC_021525	CAA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
115	NC_021525	TAA	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844790
116	NC_021525	TGT	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844790
117	NC_021525	AAT	2	6	5633	5638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844790
118	NC_021525	TAC	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844790
119	NC_021525	GCT	3	9	5706	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
120	NC_021525	A	7	7	5726	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	513844790
121	NC_021525	TTG	2	6	5787	5792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844790
122	NC_021525	GTTT	2	8	5804	5811	0 %	75 %	25 %	0 %	513844790
123	NC_021525	TGG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844790
124	NC_021525	CAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
125	NC_021525	CAGT	2	8	5946	5953	25 %	25 %	25 %	25 %	513844790
126	NC_021525	TTA	2	6	5984	5989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
127	NC_021525	ATT	2	6	6054	6059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
128	NC_021525	CCT	2	6	6165	6170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513844790
129	NC_021525	CTG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
130	NC_021525	TTA	2	6	6207	6212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
131	NC_021525	GCT	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
132	NC_021525	AGC	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844790
133	NC_021525	GAA	2	6	6450	6455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844790
134	NC_021525	AGCA	2	8	6468	6475	50 %	0 %	25 %	25 %	513844790
135	NC_021525	GTTGAT	2	12	6555	6566	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	513844790
136	NC_021525	AGT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844790
137	NC_021525	TAT	2	6	6623	6628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
138	NC_021525	TTG	2	6	6709	6714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844790
139	NC_021525	TCT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844790
140	NC_021525	TCAAT	2	10	6779	6788	40 %	40 %	0 %	20 %	513844790
141	NC_021525	GCT	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
142	NC_021525	CAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
143	NC_021525	AGA	2	6	6920	6925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844790
144	NC_021525	CTG	2	6	6967	6972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
145	NC_021525	AAC	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
146	NC_021525	TTC	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844790
147	NC_021525	AAAG	2	8	7092	7099	75 %	0 %	25 %	0 %	513844790
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186	NC_021525	ATTTA	2	10	8558	8567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.